头痛是许多脑神经衰弱患者共有的常见症状，通常局限于前额部、后枕部。但也有遍及全头，或颈项、一侧或两侧太阳穴处，或呈间断性或呈持续性胀痛，或呈跳痛，或针刺样痛，或撕裂牵拉痛。头痛往往早醒或临近起床时明显，经白天活动后逐渐缓解或消失。
心理症状
脑神经衰弱患者常出现情绪烦躁易怒、缺乏耐心、容易激动、多思多虑、焦虑不安、多梦易醒等心理症状。常常因为长期情绪紧张，导致精神疲劳、头昏脑胀、眩晕耳鸣、哈欠连连，甚至终日惶惶而不可终日，无法集中注意力，记忆力下降，工作学习无法顺利进行，工作效率大大降低。
脑神经衰弱患者多伴有睡眠障碍，多以入睡困难、睡眠浅、易醒、多梦、夜尿频繁等为主要表现。部分患者表现为睡眠质量差，睡眠感缺失，即白天常感觉困倦，但是躺到床上又睡不着。
肌肉紧性疼痛
脑神经衰弱患者常常感到头重、头胀、头部紧压感，或颈项僵硬，有的还表现为腰背四肢肌肉的游走性酸胀痛。这种肌肉紧张性疼痛综合症常常被误诊为是肌紧张性头痛。但与紧张性头痛相比，后者有明确的肌肉紧张感，疼痛呈局限性，位于肌肉紧张的部位，晨起时减轻活动后加重，无肢体麻木、无力等表现。
自主神经障碍
脑神经衰弱患者常有心跳不规律、血压波动、呼吸不规律等自主神经功能障碍的表现。患者有时还会出现厌食、便秘、阳痿、闭经等自主神经功能失调的表现。这些症状往往不是由器质性病变引起的，而是由于大脑功能活动的失调所致。
紧张性的头痛
大约有2/3的脑神经衰弱患者会出现紧张性头痛的症状。头痛呈持续性，可局限于前额部或枕颈部或全头，有时头部紧缩感会伴随焦虑和抑郁情绪出现。体检时可在颈部胸椎和枕部的软组织中触及到压痛点。这些压痛点在深部肌肉中呈小结节状且较硬，通常是无害的。但是这些压痛点也可触及到焦虑患者的敏感点，并引起疼痛和不适。
